Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Spo11Q9WTK8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms