Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Psmb3Q9R1P1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb3Q9R1P1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms