Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms