Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfwd2Q9R1A8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms