Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NrkQ9R0G8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NrkQ9R0G8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms