Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod1Q9R0E2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms