Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Npas3Q9QZQ0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Npas3Q9QZQ0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Npas3Q9QZQ0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Npas3Q9QZQ0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Npas3Q9QZQ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Npas3Q9QZQ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Npas3Q9QZQ0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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