Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clcf1Q9QZM3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcf1Q9QZM3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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