Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms