Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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