Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdh11Q9QYF1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms