Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tomm40Q9QYA2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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