Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms