Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms