Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-OaQ9QWV1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-OaQ9QWV1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms