Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcea2Q9QVN7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms