Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms