Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cdkl2Q9QUK0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl2Q9QUK0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms