Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoaQ9QUI0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RhoaQ9QUI0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms