Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip4Q9JM93 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms