Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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