Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SigirrQ9JLZ8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SigirrQ9JLZ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SigirrQ9JLZ8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms