Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms