Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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SacsQ9JLC8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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SacsQ9JLC8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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