Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hip1rQ9JKY5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hip1rQ9JKY5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hip1rQ9JKY5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hip1rQ9JKY5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hip1rQ9JKY5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hip1rQ9JKY5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hip1rQ9JKY5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hip1rQ9JKY5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms