Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms