Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msgn1Q9JK54 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms