Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga3Q9JJZ8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga3Q9JJZ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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