Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ube2j1Q9JJZ4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ube2j1Q9JJZ4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms