Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd3Q9JJY3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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