Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bco1Q9JJS6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Bco1Q9JJS6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bco1Q9JJS6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Bco1Q9JJS6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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