Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ssna1Q9JJ94 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssna1Q9JJ94 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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