Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpf2Q9JJ80 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpf2Q9JJ80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpf2Q9JJ80 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpf2Q9JJ80 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms