Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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