Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1Q9JIT0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms