Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms