Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Copb1Q9JIF7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms