Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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