Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hapln2Q9ESM3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms