Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ropn1Q9ESG2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms