Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hipk3Q9ERH7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hipk3Q9ERH7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms