Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lima1Q9ERG0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lima1Q9ERG0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lima1Q9ERG0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lima1Q9ERG0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lima1Q9ERG0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lima1Q9ERG0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lima1Q9ERG0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms