Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn12Q9ER56 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn12Q9ER56 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms