Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmn1r29Q9EQ41 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmn1r29Q9EQ41 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r29Q9EQ41 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r29Q9EQ41 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r29Q9EQ41 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r29Q9EQ41 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r29Q9EQ41 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vmn1r29Q9EQ41 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r29Q9EQ41 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r29Q9EQ41 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r29Q9EQ41 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r29Q9EQ41 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r29Q9EQ41 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r29Q9EQ41 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r29Q9EQ41 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r29Q9EQ41 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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