Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl4Q9DCU6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms