Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrpraQ9DBG7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms