Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fundc1Q9DB70 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fundc1Q9DB70 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms