Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms