Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnn3Q9DAW9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms