Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms